AT2G31320.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : poly(ADP-ribose) polymerase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Abiotic Stress-inducible gene. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
poly(ADP-ribose) polymerase 2 (PARP2); FUNCTIONS IN: NAD+ ADP-ribosyltransferase activity, NAD or NADH binding, DNA binding, zinc ion binding; INVOLVED IN: DNA repair, response to oxidative stress, response to abscisic acid stimulus, protein amino acid ADP-ribosylation, response to abiotic stimulus; LOCATED IN: intracellular, nucleus; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 12 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: PADR1 (InterPro:IPR012982), Zinc finger, PARP-type (InterPro:IPR001510), WGR (InterPro:IPR008893), Poly(ADP-ribose) polymerase, regulatory domain (InterPro:IPR004102), NAD+ ADP-ribosyltransferase (InterPro:IPR008288), Poly(ADP-ribose) polymerase, catalytic domain (InterPro:IPR012317), BRCT (InterPro:IPR001357); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: NAD+ ADP-ribosyltransferases;NAD+ ADP-ribosyltransferases (TAIR:AT5G22470.1); Has 1243 Blast hits to 1018 proteins in 163 species: Archae - 0; Bacteria - 14; Metazoa - 746; Fungi - 100; Plants - 173; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 208 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:13354046..13359578 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 111239.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 983 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASPHKPWRA EYAKSSRSSC KTCKSVINKE NFRLGKLVQS THFDGIMPMW NHASCILKKT KQIKSVDDVE GIESLRWEDQ QKIRKYVESG AGSNTSTSTG 101: TSTSSTANNA KLEYGIEVSQ TSRAGCRKCS EKILKGEVRI FSKPEGPGNK GLMWHHAKCF LEMSSSTELE SLSGWRSIPD SDQEALLPLV KKALPAAKTE 201: TAEARQTNSR AGTKRKNDSV DNEKSKLAKS SFDMSTSGAL QPCSKEKEME AQTKELWDLK DDLKKYVTSA ELREMLEVNE QSTRGSELDL RDKCADGMMF 301: GPLALCPMCS GHLSFSGGLY RCHGYISEWS KCSHSTLDPD RIKGKWKIPD ETENQFLLKW NKSQKSVKPK RILRPVLSGE TSQGQGSKDA TDSSRSERLA 401: DLKVSIAGNT KERQPWKKRI EEAGAEFHAN VKKGTSCLVV CGLTDIRDAE MRKARRMKVA IVREDYLVDC FKKQRKLPFD KYKIEDTSES LVTVKVKGRS 501: AVHEASGLQE HCHILEDGNS IYNTTLSMSD LSTGINSYYI LQIIQEDKGS DCYVFRKWGR VGNEKIGGNK VEEMSKSDAV HEFKRLFLEK TGNTWESWEQ 601: KTNFQKQPGK FLPLDIDYGV NKQVAKKEPF QTSSNLAPSL IELMKMLFDV ETYRSAMMEF EINMSEMPLG KLSKHNIQKG FEALTEIQRL LTESDPQPTM 701: KESLLVDASN RFFTMIPSIH PHIIRDEDDF KSKVKMLEAL QDIEIASRIV GFDVDSTESL DDKYKKLHCD ISPLPHDSED YRLIEKYLNT THAPTHTEWS 801: LELEEVFALE REGEFDKYAP HREKLGNKML LWHGSRLTNF VGILNQGLRI APPEAPATGY MFGKGIYFAD LVSKSAQYCY TCKKNPVGLM LLSEVALGEI 901: HELTKAKYMD KPPRGKHSTK GLGKKVPQDS EFAKWRGDVT VPCGKPVSSK VKASELMYNE YIVYDTAQVK LQFLLKVRFK HKR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)