AT2G24570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : WRKY DNA-binding protein 17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
member of WRKY Transcription Factor; Group II-d; negative regulator of basal resistance to Pseudomonas syringae. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
WRKY DNA-binding protein 17 (WRKY17); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA-binding WRKY (InterPro:IPR003657), Transcription factor, WRKY, Zn-cluster (InterPro:IPR018872); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: WRKY DNA-binding protein 11 (TAIR:AT4G31550.1); Has 3398 Blast hits to 2942 proteins in 193 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 2; Fungi - 4; Plants - 3369; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 23 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:10437676..10439222 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35013.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 10.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.51 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 321 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTVDIMRLPK MEDQTAIQEA ASQGLKSMEH LIRVLSNRPE ERNVDCSEIT DFTVSKFKKV ISLLNRSGHA RFRRGPVHSP PSSSVPPPVK VTTPAPTQIS 101: APAPVSFVQA NQQSVTLDFT RPSVFGAKTK SSEVVEFAKE SFSVSSNSSF MSSAITGDGS VSKGSSIFLA PAPAVPVTSS GKPPLSGLPY RKRCFEHDHS 201: EGFSGKISGS GNGKCHCKKS RKNRMKRTVR VPAVSAKIAD IPPDEYSWRK YGQKPIKGSP HPRGYYKCST FRGCPARKHV ERALDDSTML IVTYEGEHRH 301: HQSTMQEHVT PSVSGLVFGS A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)