AT1G73190.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Aquaporin-like superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Moves to the Protein Storage Vacuole in a Golgi independent manner | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
TIP3;1; FUNCTIONS IN: water channel activity; INVOLVED IN: autophagy, transport; LOCATED IN: plant-type vacuole membrane, protein storage vacuole, membrane, central vacuole; EXPRESSED IN: 6 plant structures; EXPRESSED DURING: seedling growth, E expanded cotyledon stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Major intrinsic protein, conserved site (InterPro:IPR022357), Aquaporin (InterPro:IPR012269), Major intrinsic protein (InterPro:IPR000425); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: beta-tonoplast intrinsic protein (TAIR:AT1G17810.1); Has 10625 Blast hits to 10599 proteins in 2166 species: Archae - 81; Bacteria - 4980; Metazoa - 1496; Fungi - 430; Plants - 2511; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1127 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:27522155..27523171 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 28309.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.89 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.63 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 268 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MATSARRAYG FGRADEATHP DSIRATLAEF LSTFVFVFAA EGSILSLDKL YWEHAAHAGT NTPGGLILVA LAHAFALFAA VSAAINVSGG HVNPAVTFGA 101: LVGGRVTAIR AIYYWIAQLL GAILACLLLR LTTNGMRPVG FRLASGVGAV NGLVLEIILT FGLVYVVYST LIDPKRGSLG IIAPLAIGLI VGANILVGGP 201: FSGASMNPAR AFGPALVGWR WHDHWIYWVG PFIGSALAAL IYEYMVIPTE PPTHHAHGVH QPLAPEDY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)