AT1G67300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 0.941 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Major facilitator superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Major facilitator superfamily protein; FUNCTIONS IN: carbohydrate transmembrane transporter activity, sugar:hydrogen symporter activity; INVOLVED IN: transport, transmembrane transport; LOCATED IN: integral to membrane, membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sugar transporter, conserved site (InterPro:IPR005829), Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), Sugar/inositol transporter (InterPro:IPR003663), General substrate transporter (InterPro:IPR005828), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Major facilitator superfamily protein (TAIR:AT1G79820.2); Has 41411 Blast hits to 40853 proteins in 2427 species: Archae - 690; Bacteria - 24236; Metazoa - 4821; Fungi - 7159; Plants - 2674; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 1829 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:25193832..25196751 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 53129.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.62 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 493 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MLGLQRETSS MYKRTSSRDY SPMIDVEDSS GLLENDVDNE METTNPSWKC SLPHVLVATI SSFLFGYHLG VVNEPLESIS SDLGFSGDTL AEGLVVSVCL 101: GGAFLGSLFS GGVADGFGRR RAFQICALPM ILGAFVSGVS NSLAVMLLGR FLVGTGMGLG PPVAALYVTE VSPAFVRGTY GSFIQIATCL GLMAALFIGI 201: PVHNITGWWR VCFWLSTIPA ALLALGMFLC AESPQWLFKQ GKIAEAEAEF ERLLGGSHVK TAMAELYKLD LDKTDEPDVV SLSELLYGRH SRVVFIGSTL 301: FALQQLSGIN AVFYFSSTVF KSAGVPSDLG NIFVGVSNLL GSVIAMVLMD KVGRKLLLLW SFIGMAAAMA LQVGATSSYL PHFSALCLSV GGTLVFVLTF 401: ALGAGPVPGL LLPEIFPSRI RAKAMAFCMS VHWVINFFVG LLFLRLLEKL GPRLLYSMFS TFCLMAVMFV KRNVIETKGK TLQEIEISLL AKP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)