AT1G61620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoinositide binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
phosphoinositide binding; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Zinc finger, RING-type, conserved site (InterPro:IPR017907), Nitric oxide synthase-interacting (InterPro:IPR016818), Zinc finger, RING-type (InterPro:IPR001841); Has 510 Blast hits to 510 proteins in 182 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 167; Fungi - 129; Plants - 138; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 76 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:22737653..22739209 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 35025.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 310 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPQRHSKNNN DLAYFTYDEK KKLGYGTQRE RLGRDSIKPF DACSLCLKPF IDPMCCHKGH VFCRECILEC FLAQKKDIQR RLAAHSSQKK QDKDEEEERL 101: MLQKARELDE FDQQNHSAMP RNSDKNHNED KNGFHGANSV KTTSFEEEAL RTMKAFWLPS ATPAASVRVD APETHTVCPE GKEKLKLKNL FAIRFTEDNS 201: EEEETKTKSA SSSSYDKSYI CPSCKVTLTN TMSLVALSSC GHVFCKKCAE KFMPVDKVCL VCDKPCKDRN LVGLKKGGTG FAEHDDHLEA KEYKHLGSGS 301: GLGLVRPVKT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)