AT1G51810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Leucine-rich repeat protein kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Leucine-rich repeat protein kinase family protein; FUNCTIONS IN: protein serine/threonine kinase activity, protein kinase activity, kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: protein amino acid phosphorylation; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009), Serine/threonine-protein kinase, active site (InterPro:IPR008271); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Leucine-rich repeat protein kinase family protein (TAIR:AT1G51820.1); Has 152900 Blast hits to 118987 proteins in 4471 species: Archae - 91; Bacteria - 12887; Metazoa - 43422; Fungi - 9576; Plants - 68632; Viruses - 377; Other Eukaryotes - 17915 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:19227119..19230584 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 82825.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.16 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 744 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MWITVNTDNT IKEILHVSKS NTLQVCLVKT GTSIPYINTL ELRPLADDIY TNESGSLNYL FRVYYSNLKG YIEYPDDVHD RIWKQILPYQ DWQILTTNLQ 101: INVSNDYDLP QRVMKTAVTP IKASTTTMEF PWNLEPPTSQ FYLFLHFAEL QSLQANETRE FNVVLNGNVT FKSYSPKFLE MQTVYSTAPK QCDGGKCLLQ 201: LVKTSRSTLP PLINAMEAYT VLDFPQIETN VDEVIAIKNI QSTYGLSKTT WQGDPCVPKK FLWDGLNCNN SDDSTPPIIT SLNLSSSGLT GIIVLTIQNL 301: ANLQELDLSN NNLSGGVPEF LADMKSLLVI NLSGNNLSGV VPQKLIEKKM LKLNIEGNPK LNCTVESCVN KDEEGGRQIK SMTIPIVASI GSVVAFTVAL 401: MIFCVVRKNN PSNDEAPTSC MLPADSRSSE PTIVTKNKKF TYAEVLTMTN NFQKILGKGG FGIVYYGSVN GTEQVAVKML SHSSAQGYKQ FKAEVELLLR 501: VHHKNLVGLV GYCEEGDKLA LIYEYMANGD LDEHMSGKRG GSILNWGTRL KIALEAAQGL EYLHNGCKPL MVHRDVKTTN ILLNEHFDTK LADFGLSRSF 601: PIEGETHVST VVAGTIGYLD PEYYRTNWLT EKSDVYSFGV VLLVMITNQP VIDQNREKRH IAEWVGGMLT KGDIKSITDP NLLGDYNSGS VWKAVELAMS 701: CMNPSSMTRP TMSQVVFELK ECLASESSRE VSMTFGTEVA PMAR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)