AT1G14687.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : homeobox protein 32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
homeobox protein 32 (HB32); FUNCTIONS IN: DNA binding, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of transcription; EXPRESSED IN: 8 plant structures; EXPRESSED DURING: F mature embryo stage, petal differentiation and expansion stage, E expanded cotyledon stage, D bilateral stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Homeobox domain, ZF-HD class (InterPro:IPR006455), ZF-HD homeobox protein, Cys/His-rich dimerisation domain (InterPro:IPR006456), Homeodomain-related (InterPro:IPR012287); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: homeobox protein 26 (TAIR:AT5G60480.1); Has 531 Blast hits to 458 proteins in 32 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:5048046..5048552 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19923.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 168 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQSTCVYREC MRNHAAKLGS YAIDGCREYS QPSTGDLCVA CGCHRSYHRR IDVISSPQIN HTRFPFTSLR RVKQLARLKW KTAEERNEEE EDDTEETSTE 101: EKMTVQRRRK SKFTAEQREA MKDYAAKLGW TLKDKRALRE EIRVFCEGIG VTRYHFKTWV NNNKKFYH |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)