AT3G22660.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : rRNA processing protein-related | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
rRNA processing protein-related; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Eukaryotic rRNA processing (InterPro:IPR008610); Has 1021 Blast hits to 939 proteins in 244 species: Archae - 0; Bacteria - 62; Metazoa - 355; Fungi - 209; Plants - 58; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 337 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:8016237..8017118 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 33207.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -1.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 293 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLEEDIVSD DEMNMIDEDD ATDSEAESLS DSDTENEITE KLAEPTKTAI YNRDGLLDKL QDISWPEDVD WTHKLTVEID QGGAVDVNDD LARETAFYTQ 101: ALEGTREAFG KLNEMGVNFL RPANYYAEMV KSDVHMEKVK SRLLHEKKQI EESEERRKAR DNKRMAKEVQ SQKMKERAKE KKDNIESVKK WRKQRQQSGF 201: SDKAGEPELD FESGKSFQRG GGKKRPGVSP GDRSGGKGRP TSRMGNKKRE FRDSKFGHGG RKGLSKQNTA ETTNDFKGGF RGGKASGNKR QKR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)