AT3G07050.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : GTP-binding family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
GTP-binding family protein; FUNCTIONS IN: GTP binding; INVOLVED IN: biological_process unknown; LOCATED IN: nucleolus; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), GTP1/OBG (InterPro:IPR006073), GTP-binding protein, HSR1-related (InterPro:IPR002917), GNL3L/Grn1 putative GTPase (InterPro:IPR014813); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: GTP-binding family protein (TAIR:AT1G52980.1); Has 11622 Blast hits to 10428 proteins in 1861 species: Archae - 158; Bacteria - 5948; Metazoa - 1715; Fungi - 910; Plants - 502; Viruses - 28; Other Eukaryotes - 2361 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:2229602..2232279 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 65789.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 582 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVKRSKKSKS KRVTLKQKHK VLKKVKEHHK KKAKDAKKLG LHRKPRVEKD PGIPNDWPFK EQELKALEVR RARALEEIEQ KKEARKERAK KRKLGLVDDE 101: DTKTEGETIE DLPKVVNVRD NSERAFYKEL VKVIELSDVI LEVLDARDPL GTRCTDMERM VMQAGPNKHL VLLLNKIDLV PREAAEKWLM YLREEFPAVA 201: FKCSTQEQRS NLGWKSSKAS KPSNMLQTSD CLGADTLIKL LKNYSRSHEL KKSITVGIIG LPNVGKSSLI NSLKRAHVVN VGATPGLTRS LQEVHLDKNV 301: KLLDCPGVVM LKSSGNDASI ALRNCKRIEK LDDPVSPVKE ILKLCPKDML VTLYKIPSFE AVDDFLYKVA TVRGKLKKGG LVDIDAAARI VLHDWNEGKI 401: PYYTMPPKRD QGGHAESKIV TELAKDFNID EVYSGESSFI GSLKTVNEFN PVIIPSNGPL NFDETMIEDE SKTQTEEEAE HESDDDESMG GEEEEEAGKT 501: KEKSETGRQN VKLYAAESML NTKKQKAEKK KRKKAKKAGA DEEDLMDGDY DFKVDYRKNK DGEDEEFQID AKIPMAGLLP EE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)