AT1G05620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : uridine-ribohydrolase 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
uridine-ribohydrolase 2 (URH2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase (InterPro:IPR001910); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: uridine-ribohydrolase 1 (TAIR:AT2G36310.1); Has 6369 Blast hits to 6297 proteins in 1349 species: Archae - 75; Bacteria - 4652; Metazoa - 179; Fungi - 246; Plants - 186; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1031 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:1679286..1681527 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 34669.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.82 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 322 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAIGDRKKII IDTDPGIDDA MAIFVALNSP EVDVIGLTTI FGNVYTTLAT RNALHLLEVA GRTDIPVAEG THKTFLNDTK LRIADFVHGK DGLGNQNFPP 101: PKGKPIEKSG PEFLVEQAKL CPGEITVVAL GPLTNLALAV QLDPEFSKNV GQIVLLGGAF AVNGNVNPAS EANIFGDPEA ADIVFTCGAD IIAVGINVTH 201: QVIMTADDKD KLASSKGKLA QYLCKILDVY YDYHLTAYEI KGVYLHDPAT ILAAFLPSLF TYTEGVARVQ TSGITRGLTL LYNNLKRFEE ANEWSDKPTV 301: KVAVTVDAPA VVKLIMDRLM ES |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)