AT5G65020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 plasma membrane 0.500 ASURE: cytosol,plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : annexin 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Annexins are calcium binding proteins that are localized in the cytoplasm. When cytosolic Ca2+ increases, they relocate to the plasma membrane. They may be involved in the Golgi-mediated secretion of polysaccharides. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
annexin 2 (ANNAT2); FUNCTIONS IN: calcium-dependent phospholipid binding, calcium ion binding; INVOLVED IN: polysaccharide transport, response to water deprivation, response to salt stress, response to cold, response to heat; LOCATED IN: cytosol, thylakoid, nucleus, cell surface; EXPRESSED IN: 26 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Annexin like protein (InterPro:IPR015472), Annexin repeat (InterPro:IPR018502), Annexin repeat, conserved site (InterPro:IPR018252), Annexin (InterPro:IPR001464), Annexin, type plant (InterPro:IPR009118); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: annexin 7 (TAIR:AT5G10230.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:25973915..25975554 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36268.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 317 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASLKVPSNV PLPEDDAEQL HKAFSGWGTN EKLIISILAH RNAAQRSLIR SVYAATYNED LLKALDKELS SDFERAVMLW TLDPPERDAY LAKESTKMFT 101: KNNWVLVEIA CTRPALELIK VKQAYQARYK KSIEEDVAQH TSGDLRKLLL PLVSTFRYEG DDVNMMLARS EAKILHEKVS EKSYSDDDFI RILTTRSKAQ 201: LGATLNHYNN EYGNAINKNL KEESDDNDYM KLLRAVITCL TYPEKHFEKV LRLSINKMGT DEWGLTRVVT TRTEVDMERI KEEYQRRNSI PLDRAIAKDT 301: SGDYEDMLVA LLGHGDA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)