AT4G11010.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : nucleoside diphosphate kinase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
nucleoside diphosphate kinase 3 (ndpk3), located to the inter-membrane space in mitochondria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Computational Description (TAIR10) |
nucleoside diphosphate kinase 3 (NDPK3); FUNCTIONS IN: nucleoside diphosphate kinase activity, cobalt ion binding, zinc ion binding, ATP binding; INVOLVED IN: response to oxidative stress; LOCATED IN: mitochondrion, mitochondrial inner membrane, plastid; EXPRESSED IN: 27 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleoside diphosphate kinase, core (InterPro:IPR001564); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Nucleoside diphosphate kinase family protein (TAIR:AT4G23900.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr4:-:6732780..6734298 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 25735.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 9.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.13 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 238 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSQICRSAS KAAKSLLSSA KNARFFSEGR AIGAAAAVSA SGKIPLYASN FARSSGSGVA SKSWITGLLA LPAAAYMIQD QEVLAAEMER TFIAIKPDGV 101: QRGLISEIIS RFERKGFKLV GIKVIVPSKD FAQKHYHDLK ERPFFNGLCD FLSSGPVIAM VWEGDGVIRY GRKLIGATDP QKSEPGTIRG DLAVTVGRNI 201: IHGSDGPETA KDEISLWFKP QELVSYTSNS EKWLYGDN |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)