AT1G63290.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Aldolase-type TIM barrel family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Aldolase-type TIM barrel family protein; FUNCTIONS IN: ribulose-phosphate 3-epimerase activity, catalytic activity; INVOLVED IN: carbohydrate metabolic process, metabolic process; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Ribulose-phosphate 3-epimerase (InterPro:IPR000056), Ribulose-phosphate binding barrel (InterPro:IPR011060); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Aldolase-type TIM barrel family protein (TAIR:AT3G01850.2); Has 8998 Blast hits to 8995 proteins in 2611 species: Archae - 49; Bacteria - 5545; Metazoa - 177; Fungi - 138; Plants - 141; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2948 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:23472095..23473590 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 24112.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.08 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 227 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MVGVSPKIAP SMLSSDFANL AAEAKRMIDL GANWLHMDIM DGHFVSNLTI GAPVIESLRK HTNAYLDCHL MVTNPMDYVD QMAKAGASGF TFHVEVAQEN 101: WQELVKKIKA AGMRPGVALK PGTPVEQVYP LVEGTNPVEM VLVMTVEPGF GGQKFMPSMM DKVRALRNKY PTLDIEVDGG LGPSTIDAAA AAGANCIVAG 201: SSVFGAPKPG DVISLLRASV EKAQPST |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)