AT2G01140.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 ASURE: plastid What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Aldolase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Aldolase superfamily protein; FUNCTIONS IN: fructose-bisphosphate aldolase activity; INVOLVED IN: response to oxidative stress, response to cadmium ion, pentose-phosphate shunt; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast, plastoglobule; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Aldolase-type TIM barrel (InterPro:IPR013785), Fructose-bisphosphate aldolase, class-I (InterPro:IPR000741); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: fructose-bisphosphate aldolase 2 (TAIR:AT4G38970.1); Has 4797 Blast hits to 4792 proteins in 909 species: Archae - 0; Bacteria - 723; Metazoa - 1159; Fungi - 8; Plants - 476; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2431 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:95006..96491 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42329.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.25 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 391 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASASFVKPN TLSSPWIGQR SFAHTSASSS PPPRVSFAIR AGAYSDELVK TAKSIASPGR GILAIDESNA TCGKRLASIG LDNTEDNRQA YRQLLLTTPG 101: LGDYISGSIL FEETLYQSTK DGKTFVDCLR DANIVPGIKV DKGLSPLAGS NEESWCQGLD GLASRSAEYY KQGARFAKWR TVVSVPCGPS ALAVKEAAWG 201: LARYAAISQD NGLVPIVEPE ILLDGDHPIE RTLEVAEKVW SEVFFYLAQN NVMFEGILLK PSMVTPGAEH KNKASPETVA DFTLTMLKRR VPPAVPGIMF 301: LSGGQSEAEA TLNLNAMNQS PNPWHVSFSY ARALQNSVLR TWQGKPEKIE ASQKALLVRA KANSLAQLGK YSAEGENEDA KKGMFVKGYT Y |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)