AT5G66120.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : 3-dehydroquinate synthase, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
3-dehydroquinate synthase, putative; FUNCTIONS IN: 3-dehydroquinate synthase activity, carbon-oxygen lyase activity, acting on phosphates; INVOLVED IN: aromatic amino acid family biosynthetic process, biosynthetic process; LOCATED IN: chloroplast; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: 3-dehydroquinate synthase AroB, subgroup (InterPro:IPR016037), 3-dehydroquinate synthase (InterPro:IPR016303), 3-dehydroquinate synthase AroB (InterPro:IPR002658); Has 8426 Blast hits to 8421 proteins in 2521 species: Archae - 162; Bacteria - 5225; Metazoa - 16; Fungi - 182; Plants - 46; Viruses - 2; Other Eukaryotes - 2793 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:26431516..26433079 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37082.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.03 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 338 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFRHVHGKRV LVVTNDRVAP LYLDKTIDAL TRGNPNVTVE SVILPDGEKY KDMDTLMKVF DKAIESRLDR RCTFVALGGG VIGDMCGYAA ASYLRGVNFI 101: QIPTTVMAQV DSSVGGKTGI NHRLGKNLIG AFYQPQCVLV DTDTLNTLPD REMASGLAEV IKYGLIRDAE FFEWQEKNIE ALLARDPAAL AFAIKRSCEN 201: KADVVSQDEK ESGLRATLNL GHTFGHAIET GFGYGEWLHG EAVAAGTVMA VDMSYRLGWI DESIVKRVNK ILVRAKLPTT PPESMTVSMF KSIMAVDKKV 301: ADGLLRLILL KGPLGNCVFT GDYDREALDA TLRAFSKS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)