AT5G57590.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate transaminases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Mutant complemented by E coli Bio A gene encoding 7,8-diaminopelargonic acid aminotransferase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
biotin auxotroph 1 (BIO1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain (InterPro:IPR015424), Aminotransferase class-III (InterPro:IPR005814), Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1 (InterPro:IPR015421); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: HOPW1-1-interacting 1 (TAIR:AT1G80600.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:23318593..23322687 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 91940.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.71 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 833 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIPVTATLIR HRLRHLRHRI RFKSTSVSPF HLPLNHPTYL IWSANTSLGK TLVSTGIAAS FLLQQPSSSA TKLLYLKPIQ TGFPSDSDSR FVFSKLDSLS 101: LRRQIPISIS NSVLHSSLPA AKSLGLNVEV SESGMCSLNF RDEKTVTGAP ELLCKTLYAW EAAISPHLAA ERENATVEDS VVLQMIEKCL KEEMECGVKS 201: EKSDLLCLVE TAGGVASPGP SGTLQCDLYR PFRLPGILVG DGRLGGISGT IAAYESLKLR GYDIAAVVFE DHGLVNEVPL TSYLRNKVPV LVLPPVPKDP 301: SDDLIEWFVE SDGVFKALKE TMVLANLERL ERLNGMAKLA GEVFWWPFTQ HKLVHQETVT VIDSRCGENF SIYKASDNSS LSQQFDACAS WWTQGPDPTF 401: QAELAREMGY TAARFGHVMF PENVYEPALK CAELLLDGVG KGWASRVYFS DNGSTAIEIA LKMAFRKFCV DHNFCEATEE EKHIVVKVIA LRGSYHGDTL 501: GAMEAQAPSP YTGFLQQPWY TGRGLFLDPP TVFLSNGSWN ISLPESFSEI APEYGTFTSR DEIFDKSRDA STLARIYSAY LSKHLQEHSG VRQSAHVGAL 601: IIEPVIHGAG GMHMVDPLFQ RVLVNECRNR KIPVIFDEVF TGFWRLGVET TTELLGCKPD IACFAKLLTG GMVPLAVTLA TDAVFDSFSG DSKLKALLHG 701: HSYSAHAMGC ATAAKAIQWF KDPETNHNIT SQGKTLRELW DEELVQQISS HSAVQRVVVI GTLFALELKA DASNSGYASL YAKSLLIMLR EDGIFTRPLG 801: NVIYLMCGPC TSPEICRRLL TKLYKRLGEF NRT |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)