AT5G46280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
MINICHROMOSOME MAINTENANCE 3 (MCM3); FUNCTIONS IN: nucleoside-triphosphatase activity, DNA-dependent ATPase activity, DNA binding, nucleotide binding, ATP binding; INVOLVED IN: cell proliferation, DNA-dependent DNA replication initiation, DNA unwinding involved in replication; LOCATED IN: nuclear chromatin; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 16 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Nucleic acid-binding, OB-fold-like (InterPro:IPR016027), Nucleic acid-binding, OB-fold (InterPro:IPR012340), ATPase, AAA+ type, core (InterPro:IPR003593), DNA-dependent ATPase MCM (InterPro:IPR001208), DNA-dependent ATPase MCM, conserved site (InterPro:IPR018525), MCM protein 3 (InterPro:IPR008046); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Minichromosome maintenance (MCM2/3/5) family protein (TAIR:AT4G02060.2); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:18769902..18773606 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 86362.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.38 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.41 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 776 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDVPEETRLR HKRDFIQFLD SMYMEEIKAL VHQKRHRLII NISDIHHHFR EVASRILKNP NEYMQSFCDA ATEATRAIDP KYLKEGELVL VGFEGYFVSR 101: VVTPRELLSD FIGSMVCVEG IVTKCSLVRP KVVKSVHFCP STGEFTNRDY RDITSHAGLP TGSVYPTRDD KGNLLVTEYG LCKYKDHQTL SIQEVPENAA 201: PGQLPRSVDV IAEDDLVDSC KPGDRVSVFG IYKALPGKSK GSVNGVFRTI LIANNIALLN KEANAPIYTK QDLDNIKNIA RRDDAFDLLA RSLAPSIYGH 301: AWIKKAVVLL MLGGVEKNLK NGTHLRGDIN MMMVGDPSVA KSQLLRAIMN IAPLAISTTG RGSSGVGLTA AVTSDQETGE RRLEAGAMVL ADKGIVCIDE 401: FDKMNDQDRV AIHEVMEQQT VTIAKAGIHA SLNARCSVVA AANPIYGTYD RSLTPTKNIG LPDSLLSRFD LLFIVLDQMD AGIDSMISEH VLRMHRYKND 501: RGEAGPDGSL PYAREDNAES EMFVKYNQTL HGKKKRGQTH DKTLTIKFLK KYIHYAKHRI TPKLTDEASE RIAEAYADLR NAGSDTKTGG TLPITARTLE 601: TIIRLATAHA KMKLSSEVTK ADAEAALKLM NFAIYHQELT EMDDREQEER QREQAEQERT PSGRRGNQRR NNEDGAENDT ANVDSETADP MEVDEPSVEQ 701: FSGTVSAARI ETFERVFGQH MRTHRLDDIS IADIETVVNN NGVGASRYSA DEIMALLEKL QDDNKVMISD GKVHII |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)