AT5G41880.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : DNA primases;DNA primases | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
POLA3; FUNCTIONS IN: DNA primase activity; INVOLVED IN: DNA replication, synthesis of RNA primer, DNA replication; EXPRESSED IN: 20 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: DNA primase, small subunit (InterPro:IPR002755), DNA primase, small subunit, eukaryotic/archaeal (InterPro:IPR014052); Has 510 Blast hits to 504 proteins in 249 species: Archae - 95; Bacteria - 0; Metazoa - 124; Fungi - 138; Plants - 44; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 109 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:16761071..16764074 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52070.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.00 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.49 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 451 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MTREETETSG EDMMIDDPKP KIENDFNVHY LRIYYGNLFP YTDIHKWLSY GHDGKHPGCD EYYFGRREFS FTLENDVYLR YKSFKNASLM EAAIKSNFPY 101: KIDIGAVYSV DPDKRHAYAQ SGTNLFTPVE RELVFDIDIT DYDDVRYCCS GADVCSKCWP LMTVAIKVID TSLREDFGFK HILWVFSGRR GVHCWVCDAK 201: ARRLTNEQRS AVAEYFRVYK GNENNAKKVD LMGHSLHPFL ARSYVDFIKS FFEGELQATQ SIFSSKEKYE KILGMITDED IQADLRGKWE NSARSSLSEE 301: ATSLLRWEQL KKALQSKRNK ALSLRTCVEE IVFTFTYPRI DLEVSKQMNH LLKAPFCVHP KTGRVCVPID PNNCDEFDPL AVPTLSQLIE EINSGGLRMD 401: VDDDDSDSSL LGKSIKFFRS SFLEPLLKSC KEEIESSYKT KIAKTKDSFS W |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)