AT1G18150.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 0.980 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Protein kinase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
ATMPK8, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATMPK8; FUNCTIONS IN: MAP kinase activity; INVOLVED IN: signal transduction; LOCATED IN: plasma membrane; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Protein kinase, ATP binding site (InterPro:IPR017441), MAP kinase, conserved site (InterPro:IPR003527), Protein kinase, catalytic domain (InterPro:IPR000719), Serine/threonine-protein kinase domain (InterPro:IPR002290), Serine/threonine-protein kinase-like domain (InterPro:IPR017442), Protein kinase-like domain (InterPro:IPR011009); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: MAP kinase 15 (TAIR:AT1G73670.1); Has 120729 Blast hits to 119418 proteins in 3824 species: Archae - 100; Bacteria - 13765; Metazoa - 44723; Fungi - 12383; Plants - 29341; Viruses - 570; Other Eukaryotes - 19847 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:6244641..6247582 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 66235.00 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.52 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.54 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 589 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGGGGNLVDG VRRWLFQRPS SSSSSSSSNN NNNNHEQPIF NSSSFSSSSN PNHSANSGEL IIEEDLDFSG LTLINVPKRN HLPMDPHKKG ETEFFTEYGE 101: ANRYQIQEVV GKGSYGVVAS AVDSHTGERV AIKKINDVFE HVSDATRILR EIKLLRLLRH PDVVEIKHIM LPPSRREFRD IYVVFELMES DLHQVIKAND 201: DLTPEHYQFF LYQLLRGLKY VHAANVFHRD LKPKNILANA DCKLKICDFG LARVSFNDAP TAIFWTDYVA TRWYRAPELC GSFFSKYTPA IDIWSVGCIF 301: AEMLLGKPLF PGKNVVHQLD LMTDFLGTPP PESISRIRNE KARRYLSSMR KKQPVPFSHK FPKADPLALR LLERLLAFDP KDRASAEDAL ADPYFSGLSN 401: SEREPTTQPI SKLEFDFERK KLVKDDVREL IYREILEYHP QMLEEYLRGG DQLSFMYPSG VDRFKRQFAH LEENQGKPGA AGGGRSTALH RHHASLPRER 501: VPAPNGETAE ESSDVERRAA AAVASTLESE EADNGGGYSA RNLMKSASIS GSKCIGVQSK TDKEDTIAEE EDNETVAELT DKVASLHNS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)