AT1G43620.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-Glycosyltransferase superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a UDP-glucose:sterol-glucosyltransferase. Mutants produce pale greenish-brown seeds whose dormancy was slightly reduced | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
UGT80B1; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring glycosyl groups, sterol 3-beta-glucosyltransferase activity; INVOLVED IN: seed germination, flavonoid biosynthetic process; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 25 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 28 (InterPro:IPR004276), UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-Glycosyltransferase superfamily protein (TAIR:AT3G07020.2); Has 2816 Blast hits to 2777 proteins in 671 species: Archae - 0; Bacteria - 1701; Metazoa - 471; Fungi - 384; Plants - 146; Viruses - 8; Other Eukaryotes - 106 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:16425654..16429500 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 68348.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.47 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.24 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 615 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASNVFDHPL QELEGEDNGV KSEKASLLET SGSVDTTPED SGHRSSDGHR GLDHCETAPV GLYGDMLIND SEIQYSRSLT EKGSPAIHNL KLDRLSEQEK 101: QKLIVELVRI QNDGTVEVID NGTPVSELWE FEPTKGQSTI TYEKSLTESF RSIPRLKIAI LVVGTRGDVQ PFLAMAKRLQ EFGHRVRLAT HANFRSFVRA 201: AGVEFYPLGG DPRELAAYMA RNKGLIPSGP SEISKQRKQL KAIIESLLPA CIEPDLETAT SFRAQAIIAN PPAYGHVHVA EALGVPIHIF FTMPWTPTNE 301: FPHPLARVPQ SAAYWLSYIV VDLMVWWSIR TYINDFRKRK LNLAPIAYFS TYHGSISHLP TGYMWSPHVV PKPSDWGPLV DVVGYCFLNL GSKYQPREEF 401: LHWIERGSPP VYIGFGSMPL DDPKQTMDII LETLKDTEQR GIVDRGWGGL GNLATEVPEN VFLVEDCPHD WLFPQCSAVV HHGGAGTTAT GLKAGCPTTI 501: VPFFGDQFFW GDRIYEKGLG PAPIPIAQLS VENLSSSIRF MLQPEVKSQV MELAKVLENE DGVAAAVDAF HRHLPPELPL PESSSEKKDE DDRPDLLQWF 601: FIQIGKKCCL PCGGV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)