AT1G51610.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Cation efflux family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Cation efflux family protein; FUNCTIONS IN: cation transmembrane transporter activity, efflux transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: cation transport, transmembrane transport; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Cation efflux protein (InterPro:IPR002524); Has 3094 Blast hits to 3092 proteins in 1095 species: Archae - 127; Bacteria - 2543; Metazoa - 129; Fungi - 0; Plants - 45; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 250 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:19136625..19139621 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 50107.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.70 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 457 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MQSSHRILSR LLHSPRKGYI RASVGGSVHF LALFDEKDNG FVDTTHRSFS SLIRSSSHVR GLISTNCLNK GLGVRCSVSL DRETPLIDTY SSHRNFFTRA 101: KQVKRIEIND QHSQRAVTTA LWCNFLVFSL KFGVWWTSSS HVIMAEVVHS VADFANQALL AYGLSSSRRA PDALHPYGYS KERFVWSLIS AVGIFCLGSG 201: ATIVNGVQNL WTSSPPPNME LAAVVIGGSF LIEGASLLVA IQSVKKGAAQ EGMTIRDYIW RGHDPTSVAV MTEDGAAVAG LAIAAASLVA VRMTGNPIYD 301: PIGSIVVGNL LGMVAIFLIQ RNRHALIGRA MDDQDMSKVL KFLRNDSVVD SLYDCKSEVI GPGSFRFKAE IDFNGQMVVQ NYLKRTGREE WAKMFREAAK 401: NGDDSAMLNI MSNYGEEVVT ALGSEVDRLE KEIQELVPGI QHVDIEAHNP TPTDPSL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)