AT5G61540.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:extracellular 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein; FUNCTIONS IN: asparaginase activity, hydrolase activity; INVOLVED IN: glycoprotein catabolic process; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase T2, asparaginase 2 (InterPro:IPR000246); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: N-terminal nucleophile aminohydrolases (Ntn hydrolases) superfamily protein (TAIR:AT3G16150.1); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:24744994..24747142 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 38251.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 359 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MARSDVLIFV STLLLFLSLL TVADAELVKS DKFPVVVSTW PFLEAVRAAW RAVDNGSSAV EAVVEGCSAC EELRCDGTVG PGGSPDENGE TMIDALVMDG 101: VTMEVGAVAA MRYVKDGIRA AHLVMKYSQH TLLAGEGASA FAISMGLPGP MNLSSPESVK KWSDWKENQC QPNFRKNVVP ANDCGPYKPN NSAMNVFVDK 201: STESCEMGAI EYKPPLVGPH NHDTISMAVI DRMGHIAVGT STNGATYKIP GRVGDGPIVG SSAYADDEVG GCGATGDGDT MMRFLPCYQV VESMRQGMKP 301: EEAAKDAISR IARKFPDFVG AVVAVDKNGS HAGACYGWTF QYSVQNPDMN DVQVFTVLP |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)