AT2G40410.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.944 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Staphylococcal nuclease homologue | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Staphylococcal nuclease homologue; FUNCTIONS IN: nuclease activity; INVOLVED IN: N-terminal protein myristoylation; LOCATED IN: cellular_component unknown; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Ca-2+ dependent nuclease (TAIR:AT3G56170.1); Has 74 Blast hits to 74 proteins in 19 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 74; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 0 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:16873509..16874711 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 25005.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.64 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 226 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGNALTFLYG KCCKPTTTDD SLGPHGVSAA TVGVSALAHD LFNFEITSQV PEGLGRYVQS SRKAQANWYR KILEAWKQAK PPPQTAEEAS RLVTDILKRN 101: QKADVEGLLS FYGLPLSHTL VEVTVEAPVS LPEGILFEFQ TLPVDPKAVA DGDTITVYVS TSEPVVSSSV PREVNLAAVQ RAKAREKRNY PKADELHQKI 201: IDSGYRVLNI ENEEVLARKF RIRLRK |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)