AT4G35020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plasma membrane 1.000 ASURE: plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RAC-like 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
A member of ROP GTPase gene family; Encodes a Rho-like GTP binding protein. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RAC-like 3 (RAC3); FUNCTIONS IN: GTP binding, GTPase activity; INVOLVED IN: protein transport, small GTPase mediated signal transduction; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), Ras GTPase (InterPro:IPR001806), Ras (InterPro:IPR013753), Ras small GTPase, Rab type (InterPro:IPR003579), Ras small GTPase, Ras type (InterPro:IPR003577), Small GTPase, Rho type (InterPro:IPR003578); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RAC-like GTP binding protein 5 (TAIR:AT1G75840.1); Has 24715 Blast hits to 24687 proteins in 684 species: Archae - 9; Bacteria - 73; Metazoa - 12739; Fungi - 3851; Plants - 2699; Viruses - 20; Other Eukaryotes - 5324 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:16673176..16674540 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21729.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.81 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 198 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSASRFIKCV TVGDGAVGKT CLLISYTSNT FPTDYVPTVF DNFSANVIVD GNTINLGLWD TAGQEDYNRL RPLSYRGADV FLLAFSLVSK ASYENVSKKW 101: VPELRHYAPG VPIILVGTKL DLRDDKQFFA EHPGAVPIST AQGEELKKLI GAPAYIECSA KTQQNVKAVF DAAIKVVLQP PKNKKKKKRK SQKGCSIL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)