AT1G75840.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.500 plasma membrane 0.500 ASURE: cytosol,plasma membrane What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : RAC-like GTP binding protein 5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Belongs to the plant-specific ROP group of Rho GTPases; localized to the plasma membrane of tips of root hairs; involved in polar growth control. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
RAC-like GTP binding protein 5 (ARAC5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ras GTPase (InterPro:IPR001806), Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), Ras (InterPro:IPR013753), Small GTPase, Rho type (InterPro:IPR003578); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: RHO-related protein from plants 2 (TAIR:AT1G20090.1); Has 24632 Blast hits to 24606 proteins in 682 species: Archae - 9; Bacteria - 69; Metazoa - 12688; Fungi - 3833; Plants - 2700; Viruses - 20; Other Eukaryotes - 5313 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:28475964..28477377 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 21778.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 196 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSASRFIKCV TVGDGAVGKT CMLISYTSNT FPTDYVPTVF DNFSANVVVD GNTVNLGLWD TAGQEDYNRL RPLSYRGADV FILAFSLISK ASYENVAKKW 101: IPELRHYAPG VPIILVGTKL DLRDDKQFFI DHPGAVPITT NQGEELKKLI GSPIYIECSS KTQQNVKAVF DAAIKVVLQP PKQKKKKKNK NRCVFL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)