AT5G57300.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein; FUNCTIONS IN: methyltransferase activity; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UbiE/COQ5 methyltransferase (InterPro:IPR004033); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferases superfamily protein (TAIR:AT1G23360.1); Has 8727 Blast hits to 8715 proteins in 2245 species: Archae - 103; Bacteria - 5342; Metazoa - 137; Fungi - 134; Plants - 200; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2811 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:23208705..23210611 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32291.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.21 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.17 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 288 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALRSVSRRL GSRILNQRSF VASLHSHATS FGFQEVKEEE KSKLVGNVFT NVASSYDIMN DVMSGGLHRL WKERLVGKLS PFAGMKHLDV AGGTGDVAFR 101: IYDAVYSVKR RALQKVDEAS LEETQIYVCD INPNMLNVGK QRAAERGLRD NKSLVWVEGD AEALSFDDNS MDGYTIAFGI RNVTHIEKAL AEAYRVLKRG 201: GRFLCLELSH VEIPVFKNLY DLYSFQVIPN LGELIAGDRE SYQYLVESVR RFPPQERFAS MIADAGFEKV EYENLVGGVV AIHSAIKL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)