AT2G42210.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17/Tim22/Tim23 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Homologous to pea OEP16 and barley pPORA (OEP16), a member of Arabidopsis OEP16 family. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
OEP16-3; FUNCTIONS IN: protein transporter activity, P-P-bond-hydrolysis-driven protein transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: protein transport; LOCATED IN: in 6 components; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Mitochondrial inner membrane translocase complex, subunit Tim17/22 (InterPro:IPR003397); Has 303 Blast hits to 303 proteins in 102 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 18; Fungi - 167; Plants - 112; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 6 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:17590642..17591591 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 17000.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.05 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 159 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDPAEMRYLE EEDGPLMKTI KGSITGFGAG TIYGTILATW KDVPRVERNV ALPGLIRTLK MMGTHGLTFA AIGGVYIGVE QLVQNFRSKR DFYNGAIGGF 101: VAGASVLGYR ARSIPTAIAA GATLAVTSAL IDSGGQTTRV DNGREYYPYT VEKRAEADS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)