AT5G57020.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Arabidopsis thaliana myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase (NMT1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase (InterPro:IPR000903), Myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase, conserved site (InterPro:IPR022678), Myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase, N-terminal (InterPro:IPR022676), Acyl-CoA N-acyltransferase (InterPro:IPR016181), Myristoyl-CoA:protein N-myristoyltransferase, C-terminal (InterPro:IPR022677); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Acyl-CoA N-acyltransferases (NAT) superfamily protein (TAIR:AT2G44175.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:23075451..23076755 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 49801.60 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.39 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 434 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MADNNSPPGS VEQKADQIVE ANPLVKDDTS LETIVRRFQD SMSEAKTHKF WETQPVGQFK DIGDTSLPEG PIEPATPLSE VKQEPYNLPS VYEWTTCDMN 101: SDDMCSEVYN LLKNNYVEDD ENMFRFNYSK EFLRWALRPP GYYQSWHIGV RAKTSKKLVA FISGVPARIR VRDEVVKMAE INFLCVHKKL RSKRLAPVMI 201: KEVTRRVHLE NIWQAAYTAG VILPTPITTC QYWHRSLNPK KLIDVGFSRL GARMTMSRTI KLYKLPDAPI TPGFRKMEPR DVPAVTRLLR NYLSQFGVAT 301: DFDENDVEHW LLPREDVVDS YLVESPETHD VTDFCSFYTL PSTILGNPNY TTLKAAYSYY NVATQTSFLQ LMNDALIVSK QKGFDVFNAL DVMHNESFLK 401: ELKFGPGDGQ LHYYLYNYRL KSALKPAELG LVLL |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)