AT5G47435.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 1.000 ASURE: mitochondrion What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : formyltetrahydrofolate deformylase, putative | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encodes one of the two putative formyltetrahydrofolate deformylase. Located in the mitochondrion. Involved in photorespiratory tetrahydrofolate cycle. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
formyltetrahydrofolate deformylase, putative; FUNCTIONS IN: hydroxymethyl-, formyl- and related transferase activity, formyltetrahydrofolate deformylase activity; INVOLVED IN: tetrahydrofolate metabolic process, purine ribonucleotide biosynthetic process, biosynthetic process, photorespiration; LOCATED IN: mitochondrion; EXPRESSED IN: 24 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Formyltetrahydrofolate deformylase (InterPro:IPR004810), Formyl transferase, N-terminal (InterPro:IPR002376); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Formyl transferase (TAIR:AT4G17360.1); Has 14552 Blast hits to 14552 proteins in 2615 species: Archae - 121; Bacteria - 10332; Metazoa - 171; Fungi - 86; Plants - 154; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 3685 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:19241779..19243424 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36453.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 323 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MIRRITERAS GFAKNIPILK SSRFHGESLD SSVSPVLIPG VHVFHCQDAV GIVAKLSDCI AAKGGNILGY DVFVPENNNV FYSRSEFIFD PVKWPRSQVD 101: EDFQTIAQRY GALNSVVRVP SIDPKYKIAL LLSKQDHCLV EMLHKWQDGK LPVDITCVIS NHERASNTHV MRFLERHGIP YHYVSTTKEN KREDDILELV 201: KDTDFLVLAR YMQILSGNFL KGYGKDVINI HHGLLPSFKG GYPAKQAFDA GVKLIGATSH FVTEELDSGP IIEQMVESVS HRDNLRSFVQ KSEDLEKKCL 301: TRAIKSYCEL RVLPYGTNKT VVF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)