AT1G17470.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.993 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : developmentally regulated G-protein 1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a member of the DRG (developmentally regulated G-protein) family expressed throughout the plant, with highest expression in actively growing tissues. Has GTPase activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
developmentally regulated G-protein 1 (DRG1); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Small GTP-binding protein (InterPro:IPR005225), TGS (InterPro:IPR004095), GTP1/OBG (InterPro:IPR006073), GTP1/OBG, conserved site (InterPro:IPR006074), GTP-binding protein, HSR1-related (InterPro:IPR002917); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein (TAIR:AT1G72660.3); Has 20324 Blast hits to 20306 proteins in 2951 species: Archae - 770; Bacteria - 13313; Metazoa - 856; Fungi - 587; Plants - 375; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 4423 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:+:6003442..6006155 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44641.80 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.93 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 399 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MGIIERIKEI EAEMARTQKN KATEYHLGQL KAKIAKLRTQ LLEPPKGASG GGEGFEVTKY GHGRVALIGF PSVGKSTLLT MLTGTHSEAA SYEFTTLTCI 101: PGVIHYNDTK IQLLDLPGII EGASEGKGRG RQVIAVAKSS DLVLMVLDAS KSEGHRQILT KELEAVGLRL NKTPPQIYFK KKKTGGISFN TTAPLTHIDE 201: KLCYQILHEY KIHNAEVLFR ENATVDDFID VIEGNRKYIK CVYVYNKIDV VGIDDVDRLS RQPNSIVISC NLKLNLDRLL ARMWDEMGLV RVYSKPQGQQ 301: PDFDEPFVLS SDRGGCTVED FCNHVHRTLV KDMKYALVWG TSTRHNPQNC GLSQHLEDED VVQIVKKKER DEGGRGRFKS HSNAPARIAD REKKAPLKQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)