AT5G43890.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.913 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Flavin-binding monooxygenase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a YUCCA-like putative flavin monooxygenase, the activation tagging mutant has increased level of IAA, increased auxin response and phenotype of auxin overproduction, rescues erecta mutant phenotype | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
YUCCA5 (YUC5); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class-II (InterPro:IPR000103), FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase (InterPro:IPR013027), Flavin-containing monooxygenase-like (InterPro:IPR020946); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: YUCCA 9 (TAIR:AT1G04180.1); Has 1807 Blast hits to 1807 proteins in 277 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 736; Fungi - 347; Plants - 385; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 339 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:17648857..17650131 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 47444.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.74 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.23 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 424 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MENMFRLMGS EDSSDRRRCI WVNGPVIVGA GPSGLATAAC LREEGVPFVV LERADCIASL WQKRTYDRIK LHLPKKVCQL PKMPFPEDYP EYPTKRQFIE 101: YLESYANKFE ITPQFNECVQ SARYDETSGL WRIKTTSSSS SGSEMEYICR WLVVATGENA EKVVPEIDGL TTEFEGEVIH SCEYKSGEKY RGKSVLVVGC 201: GNSGMEVSLD LANHNANASM VVRSSVHVLP REILGKSSFE ISMMLMKWFP LWLVDKILLI LAWLILGNLT KYGLKRPTMG PMELKIVSGK TPVLDIGAME 301: KIKSGEVEIV PGIKRFSRSH VELVDGQRLD LDAVVLATGY RSNVPSWLQE NDLFSKNGFP KSPFPNAWKG KSGLYAAGFT RKGLAGASAD AVNIAQDIGN 401: VWREETKRQK MRTRVGHRRC ISVA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)