AT5G40370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glutaredoxin family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Glutaredoxin family protein; FUNCTIONS IN: electron carrier activity, arsenate reductase (glutaredoxin) activity, protein disulfide oxidoreductase activity; INVOLVED IN: cell redox homeostasis; LOCATED IN: plasma membrane, vacuole; EXPRESSED IN: 28 plant structures; EXPRESSED DURING: 15 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glutaredoxin (InterPro:IPR002109), Thioredoxin fold (InterPro:IPR012335), Glutaredoxin subgroup (InterPro:IPR014025), Glutaredoxin active site (InterPro:IPR011767), Glutaredoxin, eukaryotic/virial (InterPro:IPR011899), Thioredoxin-like fold (InterPro:IPR012336); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Thioredoxin superfamily protein (TAIR:AT5G63030.1); Has 8321 Blast hits to 8287 proteins in 1331 species: Archae - 8; Bacteria - 4006; Metazoa - 622; Fungi - 448; Plants - 928; Viruses - 111; Other Eukaryotes - 2198 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:-:16147826..16149052 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 11757.10 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.35 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.10 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 111 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAMQKAKEIV NSESVVVFSK TYCPYCVRVK ELLQQLGAKF KAVELDTESD GSQIQSGLAE WTGQRTVPNV FIGGNHIGGC DATSNLHKDG KLVPLLTEAG 101: AIAGKTATTS A |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)