AT1G27530.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:golgi 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like (InterPro:IPR016135), Ubiquitin-fold modifier-conjugating enzyme 1 (InterPro:IPR014806); Has 269 Blast hits to 269 proteins in 110 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 175; Fungi - 0; Plants - 42; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 52 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr1:-:9562761..9563887 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19612.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.96 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.43 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 174 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEGWDPNTKS TLTRIPLLTT KAGPRDGAAW TQRLKEEYKS LIAYTQMNKS NDNDWFRISA SNPEGTRWTG KCWYVHNLLK YEFDLQFDIP ITYPATAPEL 101: ELPEIDGKTQ KMYRGGKICL TVHFKPLWAK NCPRFGIAHA LCLGLAPWLA AEIPILVDSG AIKHKDDAAT SAES |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)