AT5G03570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:vacuole 1.000 ASURE: vacuole What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : iron regulated 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes FPN2, a tonoplast localized nickel transport protein. FPN2 is one of the Arabidopsis orthologs (AT2G38460/IREG1/FPN1 and AT5G03570/IREG2/FPN2) the iron efflux transporter ferroportin (FPN) identified in animals. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
iron regulated 2 (IREG2); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Ferroporti-1 (InterPro:IPR009716), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: iron regulated 1 (TAIR:AT2G38460.1); Has 410 Blast hits to 334 proteins in 106 species: Archae - 0; Bacteria - 50; Metazoa - 178; Fungi - 61; Plants - 98; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 23 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr5:+:904514..906593 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 57097.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.04 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 512 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEEETETRVF LSNEQHQEEE EEEEEEPSLP RSMVISLYLG YFLARWGART WEFSVALYMI YLWPNSLFLT AMYGVVESGS ATLFGPIVGQ MIDGMSYVKV 101: LRLWLVTQNL SFIVAGGAVV ALLVVPDLKS QNFPVFATLV VLTNLSGAIG VLSTLAGTVL IERDWVVVMS EGHSPAVLTR MNSVIRGIDL SSKLLSPVIT 201: GLIISFVSLR ASAITFAAWA TITVWIEYWL FISVYNGVPA IVQSDERRSL RSSQSQAEET DSASSFYVPL LHEEESYRNT QSRSRILRIL ERISESSFVS 301: AWRNYLNQEI VLPGVSLALL FFTVLSFGTL MTATLEWKGI PTYIIGIGRG ISAGVGLAAT VLYPLMQSRI SPLRTGVWSF WSQWTCLLVC VGSIWVEKEK 401: IASYMLMAGV AASRLGLWMF DLAVIQQMQD LVPESDRCVV GGVQNSLQSA LDLMANLLGI IVSNPKDFWM LTLISFATVS LAGILYTIHL YRIRKHLFHL 501: EKIPLLNNFF AS |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)