AT4G37390.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.545 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Auxin-responsive GH3 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an IAA-amido synthase that conjugates Asp and other amino acids to auxin in vitro. Lines carrying insertions in this gene are hypersensitive to auxin. May function as a negative component in auxin signaling by regulating auxin activity. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
BRU6; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: GH3 auxin-responsive promoter (InterPro:IPR004993); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Auxin-responsive GH3 family protein (TAIR:AT1G59500.1); Has 1707 Blast hits to 1543 proteins in 239 species: Archae - 1; Bacteria - 597; Metazoa - 55; Fungi - 2; Plants - 674; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 378 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:17579722..17581768 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 68163.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.11 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 603 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAVDSPLQSR MVSATTSEKD VKALKFIEEM TRNPDSVQEK VLGEILTRNS NTEYLKRFDL DGVVDRKTFK SKVPVVTYED LKPEIQRISN GDCSPILSSH 101: PITEFLTSSG TSAGERKLMP TIEEDLDRRQ LLYSLLMPVM NLYVPGLDKG KGLYFLFVKS ESKTSGGLPA RPVLTSYYKS DHFKRRPYDP YNVYTSPNEA 201: ILCSDSSQSM YAQMLCGLLM RHEVLRLGAV FASGLLRAIS FLQNNWKELA RDISTGTLSS RIFDPAIKNR MSKILTKPDQ ELAEFLVGVC SQENWEGIIT 301: KIWPNTKYLD VIVTGAMAQY IPTLEYYSGG LPMACTMYAS SESYFGINLK PMCKPSEVSY TIMPNMAYFE FLPHNHDGDG AAEASLDETS LVELANVEVG 401: KEYELVITTY AGLYRYRVGD ILRVTGFHNS APQFKFIRRK NVLLSVESDK TDEAELQKAV ENASRLFAEQ GTRVIEYTSY AETKTIPGHY VIYWELLGRD 501: QSNALMSEEV MAKCCLEMEE SLNSVYRQSR VADKSIGPLE IRVVRNGTFE ELMDYAISRG ASINQYKVPR CVSFTPIMEL LDSRVVSAHF SPSLPHWSPE 601: RRR |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)