AT2G39370.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
|||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
unknown protein; BEST Arabidopsis thaliana protein match is: unknown protein (TAIR:AT2G37380.1); Has 184 Blast hits to 178 proteins in 53 species: Archae - 0; Bacteria - 58; Metazoa - 9; Fungi - 0; Plants - 103; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 14 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr2:-:16444280..16445266 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37140.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.19 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.72 | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 328 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MAAYLERCDS VEEDYIDMEV TSFTNLVRKT LSNNYPREFE FQMSHLCPLE IDKTTSPADE LFYKGKLLPL HLPPRLQMVQ KILEDYTFDD EFYSTPLATG 101: TVTTPVTSNT PFESCTVSPA ESCQVSKELN PEDYFLEYSD SLEEDDEKKK SWTTKLRLMK QSSLGTKIKA SRAYLRSFFG KTSCSDESSC ASSAARVADE 201: DSVLRYSRVK PFGQIKTERP KKQSNGSVSG SHRRSFSVSM RRQAAKSSNN KSSNSLGFRP LQFLKRSTSS SSEIENSIQG AILHCKQSQQ QKQKQKQYST 301: VNEVGFCSLS ASRIAARDDQ EWAQMFRG |
||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)