AT4G30570.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Glucose-1-phosphate adenylyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Glucose-1-phosphate adenylyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, nucleotidyltransferase activity; INVOLVED IN: biosynthetic process; EXPRESSED IN: 17 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Trimeric LpxA-like (InterPro:IPR011004), Nucleotidyl transferase (InterPro:IPR005835); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Glucose-1-phosphate adenylyltransferase family protein (TAIR:AT2G39770.2); Has 20365 Blast hits to 20356 proteins in 2848 species: Archae - 923; Bacteria - 14729; Metazoa - 391; Fungi - 293; Plants - 329; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 3700 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:14930706..14931951 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 36575.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 4.85 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.02 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 331 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MPKPLVDFGN KPMILHQIEA LKGAGVTEVV LAINHQQPEV MLNFVKEYEK KLEIKITFSQ ETEPLGTAGP LALARDKLVD ESGQPFFVLN SDVICEYPLL 101: EMIEFHKTNR AEASIMVTEV DDPSKYGVVV TEEGTARVES FVEKPKHFVG NKINAGIYLL SPSVLDRIEL RRTSIEKEIF PKIASEKKLY AMVLPGFWMD 201: IGQPKDYITG QRMYLNSLRE KTPQELATGD NIIGNVLVHE SAVIGEGCLI GPDVVIGPGC VIDSGVRLFG CTVMRGVWIK EHACISNSIV GWDSTVGRWA 301: RVFNITVLGK DVNVADAEVY NSGVVIEEQG L |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)