AT4G26940.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:endoplasmic reticulum 0.771 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : Galactosyltransferase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
Galactosyltransferase family protein; FUNCTIONS IN: transferase activity, transferring hexosyl groups, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: protein amino acid glycosylation; LOCATED IN: membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 31 (InterPro:IPR002659); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Galactosyltransferase family protein (TAIR:AT1G05170.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr4:-:13529911..13532387 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 46022.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 7.29 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 407 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSLKHHHRGL ELSASKSFVS KKWTLFLCIG FFCAGILFSD RMWPEPESNV VSRDTVASDE RLRLESEDCD SSKKGLKRES KDILGDVYKS PDAIQTLDKT 101: ISKLETELAD ARAAQESIMN GSPVSDDFKL PETVTKRKYL MVVGVNTAFS SRKRRDSVRA TWMPPGEERK KLEEEKGIVM RFVIGHSSTP GGILDRAIQA 201: EESKHGDFLR LDHVEGYLEL SAKTKTYFTT AFAMWDADFY VKVDDDVHVN IATLGAELAR YRMKPRVYIG CMKSGPVLAQ KGVRYHEPEY WKFGEEGNKY 301: FRHATGQLYA ISRELASYIS INQNVLHKYV NEDVSLGSWF LGLDVEHVDD RRLCCGTTDC EWKAQAGNIC VASFDWSCSG ICRSADRMKD VHRRCGEGEK 401: ALLAASF |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)