AT4G24160.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:peroxisome 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : alpha/beta-Hydrolases superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a soluble lysophosphatidic acid acyltransferase with additional triacylglycerol lipase and phosphatidylcholine hydrolyzing enzymatic activities. Plays a pivotal role in maintaining the lipid homeostasis by regulating both phospholipid and neutral lipid levels. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
alpha/beta-Hydrolases superfamily protein; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Alpha/beta hydrolase fold-1 (InterPro:IPR000073); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: alpha/beta-Hydrolases superfamily protein (TAIR:AT1G64670.1); Has 13697 Blast hits to 13658 proteins in 1951 species: Archae - 114; Bacteria - 10198; Metazoa - 427; Fungi - 417; Plants - 428; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2113 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:12539871..12542210 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 46528.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 418 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNLSRFASRL RMAEEISKTK VGSSSTASVA DSSAAASAAT NAAKSRWKIL WPNSLRWIPT STDYIIAAEK RLLSILKTPY VQEQVSIGSG PPGSKIRWFR 101: STSNESRYIN TVTFDAKEGA PTLVMVHGYG ASQGFFFRNF DALASRFRVI AIDQLGWGGS SRPDFTCRST EETEAWFIDS FEEWRKAQNL SNFILLGHSF 201: GGYVAAKYAL KHPEHVQHLI LVGSAGFSAE ADAKSEWLTK FRATWKGAVL NHLWESNFTP QKLVRGLGPW GPGLVNRYTT ARFGAHSEGT GLTEEEAKLL 301: TDYVYHTLAA KASGELCLKY IFSFGAFARK PLLQSASEWK VPTTFIYGMN DWMNYQGAVE ARKSMKVPCE IIRVPQGGHF VFIDNPIGFH SAVLYACRKF 401: ISQDSSHDQQ LLDGLRLV |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)