AT2G15480.1
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min: :max .
SUBAcon:plasma membrane 0.715 What is SUBAcon? |
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Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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Description (TAIR10) | protein_coding : UDP-glucosyl transferase 73B5 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Curator Summary (TAIR10) |
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Computational Description (TAIR10) |
UDP-glucosyl transferase 73B5 (UGT73B5); FUNCTIONS IN: quercetin 3-O-glucosyltransferase activity, UDP-glycosyltransferase activity, UDP-glucosyltransferase activity, transferase activity, transferring glycosyl groups; INVOLVED IN: response to other organism; LOCATED IN: endomembrane system; EXPRESSED IN: 9 plant structures; EXPRESSED DURING: L mature pollen stage, M germinated pollen stage, LP.04 four leaves visible, 4 anthesis, petal differentiation and expansion stage; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase (InterPro:IPR002213); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: UDP-glycosyltransferase 73B4 (TAIR:AT2G15490.3); Has 6808 Blast hits to 6730 proteins in 439 species: Archae - 0; Bacteria - 297; Metazoa - 1215; Fungi - 23; Plants - 5119; Viruses - 118; Other Eukaryotes - 36 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Protein Annotations |
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Coordinates (TAIR10) | chr2:+:6758817..6760452 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Weight (calculated) | 54187.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IEP (calculated) | 7.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GRAVY (calculated) | -0.26 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Length | 484 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MNREVSERIH ILFFPFMAQG HMIPILDMAK LFSRRGAKST LLTTPINAKI FEKPIEAFKN QNPDLEIGIK IFNFPCVELG LPEGCENADF INSYQKSDSG 101: DLFLKFLFST KYMKQQLESF IETTKPSALV ADMFFPWATE SAEKLGVPRL VFHGTSFFSL CCSYNMRIHK PHKKVATSST PFVIPGLPGD IVITEDQANV 201: AKEETPMGKF MKEVRESETN SFGVLVNSFY ELESAYADFY RSFVAKRAWH IGPLSLSNRE LGEKARRGKK ANIDEQECLK WLDSKTPGSV VYLSFGSGTN 301: FTNDQLLEIA FGLEGSGQSF IWVVRKNENQ GDNEEWLPEG FKERTTGKGL IIPGWAPQVL ILDHKAIGGF VTHCGWNSAI EGIAAGLPMV TWPMGAEQFY 401: NEKLLTKVLR IGVNVGATEL VKKGKLISRA QVEKAVREVI GGEKAEERRL WAKKLGEMAK AAVEEGGSSY NDVNKFMEEL NGRK |
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See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)