AT4G14147.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.809 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : protein binding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
actin-related protein 2/3 complex 34kDa subunit family / arp2/3 complex 34kDa subunit family | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ARPC4; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: ARP23 complex 20kDa subunit (InterPro:IPR008384); Has 35333 Blast hits to 34131 proteins in 2444 species: Archae - 798; Bacteria - 22429; Metazoa - 974; Fungi - 991; Plants - 531; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 9610 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:8154079..8156246 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 19859.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 7.77 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.22 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 169 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANSLRLYLA CIKNTLEAAM CLQNFPCQEV ERHNKPEVEL KTSPELLLNP VLICRNEAEK CLIETSINSL RISLKVKQAD ELENILTKKF LRFLSMRAEA 101: FQVLRRKPVQ GYDISFLITN YHCEEMQKQK LIDFIIQFME DIEKEIRDLK ESVNTRGRLV ATEFLKQFM |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)