AT4G04040.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 ASURE: cytosol What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Phosphofructokinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
maternal effect embryo arrest 51 (MEE51); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Pyrophosphate-dependent phosphofructokinase PfpB (InterPro:IPR011183), Phosphofructokinase (InterPro:IPR000023); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Phosphofructokinase family protein (TAIR:AT1G12000.1); Has 30201 Blast hits to 17322 proteins in 780 species: Archae - 12; Bacteria - 1396; Metazoa - 17338; Fungi - 3422; Plants - 5037; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2996 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:1939250..1942765 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 62745.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.32 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.27 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 569 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MASQLDLIGG DYIAGISINP PTNSRVTSVY SEVQASRIDH TLPLPSVFKT PFKIIDGPPS SSAGHPEEIE KLFPNLFGQP SALLVPNQSN EVSSDQKLKI 101: GVVLSGGQAP GGHNVICGIF DYLQEYARGS SLFGFRGGPA GIMKGKYIEL TSEFVYPYRN QGGFDMICSG RDKIETPEQF KQAEETVTKM DLDGLVVIGG 201: DDSNTNACLL AEHFRAKNMK TLVIGCPKTI DGDLKSKEVP TSFGFDTACK IYSEMIGNVM IDARSTGKYY HFVRLMGRAA SHITLECALQ THPNITIIGE 301: EVFEKKLTLK NVTDNIVDVI YKRAENGYNY GVILVPEGLI DFIPEVQQLI SELNEVLAEG NVDEEGQWKK NLKKETLEIF EFLPQTIQEQ LMLERDPHGN 401: VQVAKIETEK MLIQMVETEL EKKKTEGTYE REFMGKSHFF GYEGRCGLPT NFDATYCYAL GYGAGSLLQS GKTGLISSVG NLAAPVEEWT VGGTALTSLM 501: DVERRHGKFK PVIKKAMVEL EGAPFKKFAS QREEWALKNR YISPGPIQFK GPGSDARNHT LMLELGAQA |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)