AT4G33770.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Inositol 1,3,4-trisphosphate 5/6-kinase family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
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| Computational Description (TAIR10) |
Inositol 1,3,4-trisphosphate 5/6-kinase family protein; FUNCTIONS IN: inositol or phosphatidylinositol kinase activity, magnesium ion binding, inositol-1,3,4-trisphosphate 5/6-kinase activity, inositol tetrakisphosphate 1-kinase activity, ATP binding; INVOLVED IN: inositol trisphosphate metabolic process; LOCATED IN: intracellular; EXPRESSED IN: 21 plant structures; EXPRESSED DURING: 9 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Inositol-tetrakisphosphate 1-kinase (InterPro:IPR017427), Inositol 1, 3, 4-trisphosphate 56-kinase (InterPro:IPR008656); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Inositol 1,3,4-trisphosphate 5/6-kinase family protein (TAIR:AT4G08170.2); Has 392 Blast hits to 387 proteins in 75 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 96; Fungi - 0; Plants - 249; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 47 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:16193589..16196242 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 44174.40 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.53 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 391 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MFGTLASGEI ETARLNRNLG ITSNLGVSCG GFEDFAMRFE GENMVPYKGE EQEEEEDQVV VNETTPFQFQ QPLFLQQQQK LVVGYALTSK KKKSFLQPKL 101: ELLARRKGIF FVAIDLNRPL SEQGPFDVVL HKLLGKEWEE VIEDYQQKHP EVTVLDPPGS IQRIYNRQSM LQGMADLKLS DCSGSLFVPK QMVVLKDSAA 201: SADAVVEAGL KFPLVAKPLW IDGTAKSHQL YLAYDRRSLA ELDPPLVLQE FVNHGGVMFK VFVVGDVIKV MRRFSLPNVS NCEKAKVDGV FQFPRVSSAA 301: ASADNADLDP RVAELPPKPF LEALVKELRS LLGLRLFNID MIREHGSKNV FYVIDINYFP GYGKLPDYEQ VFVDFFQNLA QVKYKKRQHC K |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)