AT2G11810.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:mitochondrion 0.990 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : monogalactosyldiacylglycerol synthase type C | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
MGD3 is the major enzyme for galactolipid metabolism during phosphate starvation. Does not contribute to galactolipid synthesis under P1-sufficient conditions. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
monogalactosyldiacylglycerol synthase type C (MGDC); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Glycosyl transferase, family 28, C-terminal (InterPro:IPR007235), Monogalactosyldiacylglycerol synthase (InterPro:IPR009695); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: monogalactosyldiacylglycerol synthase 2 (TAIR:AT5G20410.1); Has 2157 Blast hits to 2157 proteins in 790 species: Archae - 0; Bacteria - 1916; Metazoa - 0; Fungi - 0; Plants - 110; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 131 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr2:+:4743388..4746633 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 52993.20 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 8.44 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.30 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 465 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MMKVVSPRTR SDSITEKVFR RVYSNFNIST VEDEYIHRQR SSDYEKESRL RKRGLEDKEE VMEMEQMGAE RIKTVLILMS DTGGGHRASA EAIRDAFKIE 101: FGDDYRIIIK DVWKEYTGWP LNDMERQYKF MVKHVGLWSV AFHGTSPKWI HKSYLSALAA YYAKEIEAGL MEYKPDIIIS VHPLMQHIPL WVMKWQGLHK 201: KVIFVTVITD LNTCHRTWFH HGVSRCYCPS KEVAKRALVD GLDDSQIRVF GLPVRPSFPR TILNKNELRK ELEIDLNLPA VLLMGGGEGM GPVQKTALAL 301: GDSLYNSKES NPIGQLIVIC GRNKVLASTL ASHEWKIPVK VRGFETQMEK WMGACDCIIT KAGPGTIAEA LICGLPIILN DYIPGQEKGN VPYVVDNGAG 401: VFTRSPKETA KIVADWFSNN KEELKKMSEN ALKLSQPEAV FDIVKDIHHL SQQQQRIPLF NEFSY |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)