AT4G02280.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 0.999 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : sucrose synthase 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes a protein with sucrose synthase activity (SUS3). It appears to be important for sucrose metabolism in developing seeds, especially during the late maturation phase, about 18 days after flowering. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
sucrose synthase 3 (SUS3); CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Sucrose synthase, plant/cyanobacteria (InterPro:IPR012820), Sucrose synthase (InterPro:IPR000368), Glycosyl transferase, group 1 (InterPro:IPR001296); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: sucrose synthase 2 (TAIR:AT5G49190.1); Has 6506 Blast hits to 6505 proteins in 1621 species: Archae - 256; Bacteria - 4351; Metazoa - 95; Fungi - 50; Plants - 824; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 930 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:+:995166..998719 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 92007.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.20 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.28 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 809 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MANPKLTRVL STRDRVQDTL SAHRNELVAL LSRYVDQGKG ILQPHNLIDE LESVIGDDET KKSLSDGPFG EILKSAMEAI VVPPFVALAV RPRPGVWEYV 101: RVNVFELSVE QLTVSEYLRF KEELVDGPNS DPFCLELDFE PFNANVPRPS RSSSIGNGVQ FLNRHLSSVM FRNKDCLEPL LDFLRVHKYK GHPLMLNDRI 201: QSISRLQIQL SKAEDHISKL SQETPFSEFE YALQGMGFEK GWGDTAGRVL EMMHLLSDIL QAPDPSSLEK FLGMVPMVFN VVILSPHGYF GQANVLGLPD 301: TGGQVVYILD QVRALETEML LRIKRQGLDI SPSILIVTRL IPDAKGTTCN QRLERVSGTE HTHILRVPFR SEKGILRKWI SRFDVWPYLE NYAQDAASEI 401: VGELQGVPDF IIGNYSDGNL VASLMAHRMG VTQCTIAHAL EKTKYPDSDI YWKDFDNKYH FSCQFTADLI AMNNADFIIT STYQEIAGTK NTVGQYESHG 501: AFTLPGLYRV VHGIDVFDPK FNIVSPGADM TIYFPYSEET RRLTALHGSI EEMLYSPDQT DEHVGTLSDR SKPILFSMAR LDKVKNISGL VEMYSKNTKL 601: RELVNLVVIA GNIDVNKSKD REEIVEIEKM HNLMKNYKLD GQFRWITAQT NRARNGELYR YIADTRGAFA QPAFYEAFGL TVVEAMTCGL PTFATCHGGP 701: AEIIEHGLSG FHIDPYHPEQ AGNIMADFFE RCKEDPNHWK KVSDAGLQRI YERYTWKIYS ERLMTLAGVY GFWKYVSKLE RRETRRYLEM FYILKFRDLV 801: KTVPSTADD |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)