AT4G00370.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : Major facilitator superfamily protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an inorganic phosphate transporter (PHT4;4). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ANTR2; FUNCTIONS IN: organic anion transmembrane transporter activity, inorganic phosphate transmembrane transporter activity; INVOLVED IN: transmembrane transport; LOCATED IN: chloroplast, plastid; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 13 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Major facilitator superfamily (InterPro:IPR020846), Major facilitator superfamily MFS-1 (InterPro:IPR011701), Major facilitator superfamily, general substrate transporter (InterPro:IPR016196); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: phosphate transporter 4;1 (TAIR:AT2G29650.1); Has 37886 Blast hits to 37799 proteins in 2473 species: Archae - 506; Bacteria - 30466; Metazoa - 2514; Fungi - 1637; Plants - 427; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 2336 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr4:-:163153..166111 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 59616.90 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.40 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.33 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 541 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MALGGLISNR NFGSFIGSGN GCQRLGKSGA EVSKLFPNAL LCRNHQPLQA SLHHESGHMR RSFGCFLQPR MDSVIRFRNS IKINRSRAYY KSEESDITEG 101: VVPSADGSAE AILVEGNLQN ASPWWQQFPR RWVIVLLCFS SFLLCNMDRV NMSIAILPMS QEYNWSSATV GLIQSSFFWG YLLTQILGGI WADKFGGKVV 201: LGFGVVWWSF ATIMTPIAAR LGLPFLLVVR AFMGIGEGVA MPAMNNMLSK WIPVSERSRS LALVYSGMYL GSVTGLAFSP MLITKFGWPS VFYSFGSLGS 301: IWFLLWLKFA YSSPKDDPDL SEEEKKVILG GSKPREPVTV IPWKLILSKP PVWALIISHF CHNWGTFILL TWMPTYYNQV LKFNLTESGL LCVLPWLTMA 401: VFANIGGWIA DTLVSRGLSI TNVRKIMQSI GFLGPAFFLS QLSHVKTPAM AVLCMACSQG SDAFSQSGLY SNHQDIGPRY AGVLLGLSNT AGVLAGVFGT 501: AATGYILQRG SWDDVFKVAV ALYLIGTLVW NLFATGEKIL D |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)