AT3G56850.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : ABA-responsive element binding protein 3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
Encodes an ABA-responsive element binding protein with a bZIP domain. Located in the nucleus and expressed in the embryo during seed maturation. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ABA-responsive element binding protein 3 (AREB3); FUNCTIONS IN: DNA binding, transcription activator activity, sequence-specific DNA binding transcription factor activity; INVOLVED IN: regulation of transcription, DNA-dependent, response to stress; LOCATED IN: nucleus; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor (InterPro:IPR004827), bZIP transcription factor, bZIP-1 (InterPro:IPR011616); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein (TAIR:AT2G41070.2); Has 2031 Blast hits to 1971 proteins in 156 species: Archae - 0; Bacteria - 0; Metazoa - 263; Fungi - 29; Plants - 1672; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 67 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:21046554..21047894 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 32420.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 9.95 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.75 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 297 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MDSQRGIVEQ AKSQSLNRQS SLYSLTLDEV QNHLGSSGKA LGSMNLDELL KSVCSVEANQ PSSMAVNGGA AAQEGLSRQG SLTLPRDLSK KTVDEVWKDI 101: QQNKNGGSAH ERRDKQPTLG EMTLEDLLLK AGVVTETIPG SNHDGPVGGG SAGSGAGLGQ NITQVGPWIQ YHQLPSMPQP QAFMPYPVSD MQAMVSQSSL 201: MGGLSDTQTP GRKRVASGEV VEKTVERRQK RMIKNRESAA RSRARKQAYT HELEIKVSRL EEENERLRKQ KEVEKILPSV PPPDPKRQLR RTSSAPF |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)