AT3G44460.1
|
Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:nucleus 1.000 ASURE: nucleus What is SUBAcon? |
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Experimental Localisations and PPI |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|
SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Description (TAIR10) | protein_coding : Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
basic leucine zipper transcription factor (BZIP67), identical to basic leucine zipper transcription factor GI:18656053 from (Arabidopsis thaliana); identical to cDNA basic leucine zipper transcription factor (atbzip67 gene) GI:18656052. Located in the nucleus and expressed during seed maturation in the cotyledons. | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
DPBF2; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor (InterPro:IPR004827), bZIP transcription factor, bZIP-1 (InterPro:IPR011616); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: ABA-responsive element binding protein 3 (TAIR:AT3G56850.1); Has 1284 Blast hits to 1176 proteins in 119 species: Archae - 0; Bacteria - 2; Metazoa - 145; Fungi - 6; Plants - 1088; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 43 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:16080115..16081722 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 37667.30 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.69 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.86 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 331 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSVFESETSN FHVYNNHEIQ TQPQMQTFLS EEEPVGRQNS ILSLTLDEIQ MKSGKSFGAM NMDEFLANLW TTVEENDNEG GGAHNDGEKP AVLPRQGSLS 101: LPVPLCKKTV DEVWLEIQNG VQQHPPSSNS GQNSAENIRR QQTLGEITLE DFLVKAGVVQ EPLKTTMRMS SSDFGYNPEF GVGLHCQNQN NYGDNRSVYS 201: ENRPFYSVLG ESSSCMTGNG RSNQYLTGLD AFRIKKRIID GPPEILMERR QRRMIKNRES AARSRARRQA YTVELELELN NLTEENTKLK EIVEENEKKR 301: RQEIISRSKQ VTKEKSGDKL RKIRRMASAG W |
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| See Also |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)