AT3G55010.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:plastid 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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| FP Images |
Arabidopsis cell culture (mitochondrial marker)
Arabidopsis cell culture (plastidal marker)
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase, chloroplast / phosphoribosyl-aminoimidazole synthetase / AIR synthase (PUR5) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
encoding phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase (syn. AIR synthetase)that phosphorylates 5-phosphoribosyl-N-formylglycinamidine (FGAM) to form 5-aminoimidazole ribonucleotide (AIR) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
PUR5; FUNCTIONS IN: phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase activity, copper ion binding, ATP binding; INVOLVED IN: purine nucleotide biosynthetic process; LOCATED IN: mitochondrion, chloroplast; EXPRESSED IN: 22 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: PurM, N-terminal-like (InterPro:IPR016188), AIR synthase related protein (InterPro:IPR000728), AIR synthase related protein, C-terminal (InterPro:IPR010918), Phosphoribosylformylglycinamidine cyclo-ligase (InterPro:IPR004733); Has 9318 Blast hits to 9280 proteins in 2601 species: Archae - 368; Bacteria - 5515; Metazoa - 245; Fungi - 143; Plants - 73; Viruses - 3; Other Eukaryotes - 2971 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:+:20386818..20388549 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 41506.70 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 5.14 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | 0.01 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 389 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MEARILQSSS SCYSSLYAVN RSRFSSVSSP KPFSVSFAQT TRTRTRVLSM SKKDGRTDKD DDTDSLNYKD SGVDIDAGAE LVKRIAKMAP GIGGFGGLFP 101: LGDSYLVAGT DGVGTKLKLA FETGIHDTIG IDLVAMSVND IITSGAKPLF FLDYFATSRL DVDLAEKVIK GIVEGCRQSE CALLGGETAE MPDFYAEGEY 201: DLSGFAVGIV KKTSVINGKN IVAGDVLIGL PSSGVHSNGF SLVRRVLARS NLSLKDALPG GSSTLGDALM APTVIYVKQV LDMIEKGGVK GLAHITGGGF 301: TDNIPRVFPD GLGAVIHTDA WELPPLFKWI QQTGRIEDSE MRRTFNLGIG MVMVVSPEAA SRILEEVKNG DYVAYRVGEV VNGEGVSYQ |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)