AT3G51800.1
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Subcellular Consensus
(Prediction and Experimental) min:  :max.
SUBAcon:cytosol 1.000 What is SUBAcon? |
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| Experimental Localisations and PPI |
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SUBAcon links
AGI-AGI relationships |
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| Description (TAIR10) | protein_coding : metallopeptidase M24 family protein | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Curator Summary (TAIR10) |
putative nuclear DNA-binding protein G2p (AtG2) mRNA, | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Computational Description (TAIR10) |
ATG2; FUNCTIONS IN: metalloexopeptidase activity, aminopeptidase activity; INVOLVED IN: proteolysis, cellular process; LOCATED IN: nucleolus, plasma membrane; EXPRESSED IN: 23 plant structures; EXPRESSED DURING: 14 growth stages; CONTAINS InterPro DOMAIN/s: Peptidase M24, structural domain (InterPro:IPR000994), Proliferation-associated protein 1 (InterPro:IPR004545), Peptidase M24, methionine aminopeptidase (InterPro:IPR001714); BEST Arabidopsis thaliana protein match is: methionine aminopeptidase 2A (TAIR:AT2G44180.1); Has 7405 Blast hits to 7404 proteins in 2313 species: Archae - 229; Bacteria - 4673; Metazoa - 502; Fungi - 534; Plants - 197; Viruses - 0; Other Eukaryotes - 1270 (source: NCBI BLink). | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Protein Annotations |
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| Coordinates (TAIR10) | chr3:-:19211261..19213568 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Molecular Weight (calculated) | 42981.50 Da | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| IEP (calculated) | 6.79 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| GRAVY (calculated) | -0.42 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Length | 392 amino acids | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence (TAIR10) (BLAST) |
001: MSSDDERDEK ELSLTSPEVV TKYKSAAEIV NKALQVVLAE CKPKAKIVDI CEKGDSFIKE QTASMYKNSK KKIERGVAFP TCISVNNTVG HFSPLASDES 101: VLEDGDMVKI DMGCHIDGFI ALVGHTHVLQ EGPLSGRKAD VIAAANTAAD VALRLVRPGK KNTDVTEAIQ KVAAAYDCKI VEGVLSHQLK QHVIDGNKVV 201: LSVSSPETTV DEVEFEENEV YAIDIVASTG DGKPKLLDEK QTTIYKKDES VNYQLKMKAS RFIISEIKQN FPRMPFTARS LEEKRARLGL VECVNHGHLQ 301: PYPVLYEKPG DFVAQIKFTV LLMPNGSDRI TSHTLQELPK KTIEDPEIKG WLALGIKKKK GGGKKKKAQK AGEKGEASTE AEPMDASSNA QE |
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| See Also |
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Citation
If you find this resource useful please cite one of the following publications:
Hooper CM, Castleden I, Tanz SK, Aryamanesh, and Millar, AH (2017) SUBA4: the interactive data analysis centre for Arabidopsis subcellular protein locations Nucleic Acids Res. Jan 4;45(D1):D1064-D1074. doi: 10.1093/nar/gkw1041 (PubMed)
Hooper CM, Tanz SK, Castleden IR, Vacher MA, Small ID, Millar AH (2014) "SUBAcon: a consensus algorithm for unifying the subcellular localization data of the Arabidopsis proteome. Bioinformatics." 1;30(23):3356-64. (Bioinformatics) (PubMed)